Fue fundado en 1º de Noviembre de 1908 por un grupo de muchachos del barrio de Pompeya aunque en el acta número uno figura que esta es la fecha de refundación, la oficial, porque el club se habría creado el 25 de mayo de 1903 pero otros documentos afirman que fue en 1907.
Su primer presidente fue José Lagunas y desde un comienzo se decidió que la camiseta sea blanca con el distintivo del globo en el lado izquierdo. La elección del nombre fue casual porque este grupo de jóvenes se había decido por el nombre "Verde Esperanza y no se pierde" o "Verde Esperanza y no pierde". Juntan dos pesos con cincuenta centavos para hacer el primer sello de la institución y se dirigen a la librería de Richino que se ubicaba en la Avenida Saenz y Esquiú. Existen dos versiones con respecto al cambio de nombre. Una dice que el dinero no les alcanzaba para un nombre tan largo en el sello y el otro dice que el mismo Richino les aconsejó que no era ideal para un club y este, viendo un aviso publicitario en la pared que decía "El Huracán" les sugirió ese nombre.
El primer estadio lo tuvo en la calle Almafuerte (antes se llamaba Arena) y el segundo que utilizó se ubicaba en Avenida La Plata y Avenida Chiclana. En 1939, luego de una asamblea de socios, se decide pedir un préstamo al Gobierno Nacional, este se lo da y, en 1941, se pone la piedra fundamental en el terreno donde se ubica el estadio actual, en Avenida Amancio Alcorta y Luna. Luego de ocho años de intenso trabajo logran inaugurarlo el 11 de noviembre de 1949 en un encuentro amistoso ante Peñarol de Montevideo al cual venció por 4 a 1 aunque la habilitación oficial fue dos años antes, 7 de septiembre de 1947, en un encuentro que disputó ante Boca.
Con respecto a lo futbolístico, en 1921 obtiene su primer título en el campeonato organizado por la Asociación Argentina y vuelve a repetir en 1922 y 1925, años donde también ganó la Copa Ibarguren, mientras que en 1927 consiguió el campeonato de la Olimpíadas de San Juan.
Al año siguiente, en 1928, otra vez se convierte en campeón aunque en esta oportunidad el torneo estuvo avalado por la Asociación Amateur Argentina. En 1931 forma parte de la reestructuración del fútbol en el país y es uno de los participantes del primer campeonato profesional. En 1933 obtiene la Copa Consolación Becar Varela luego de vencer en la final a Lanús y en 1936 obtuvo el subcampeonato del Torneo de Honor que fue la primera ronda del campeonato oficial de ese año.
En 1942 y 1943 ganó la Copa Adrián Escobar y en 1944 obtuvo el trofeo de la Copa Competencia Británica. En 1949 fue el primer año donde estuvo a punto de perder la categoría. Igualó la última posición ante Lanús y tuvo que jugar cuatro encuentros ante el "granate" para decidir quien iba a jugar la próxima temporada de la Primera B. En primer partido lo gana Huracán 1 a 0, En el segundo vence Lanús 4 a 1, el tercero lo empatan 3 a 3 y finalmente el "quemero" vence en el cuarto por 3 a 2.
En 1950 otra mala campaña lo lleva a la misma instancia que en el torneo anterior. En esta oportunidad iguala el penúltimo lugar ante Tigre y lo vence por 5 a 1 para conservar una vez más la categoría. Luego de varios años donde las actuaciones lo tenían mayoritariamente en mitad de tabla, llegó la década del 70 que fue la mejor en la historia de la institución. Todo comenzó en 1972 cuando obtuvo la tercera posición en el Metropolitano y 1973 consiguió su único título en Primera División con un equipo dirigido por César Menotti y que para muchos fue el mejor de la historia del fútbol argentino por su juego vistoso y ofensivo.
De ese conjunto salieron varios jugadores que formaron parte de la Selección Argentina, con Babington y Brindisi como abanderados. En 1974 participa de la Copa Libertadores de América y se transforma en uno de los mejores conjuntos del continente al llegar a semifinales. En 1975 se convierte en el subcampeón del Metropolitano, detrás del campeón River, a cuatro puntos. Eso le permite jugar un partido ante Estudiantes de La Plata para ver quien iba a ser el representante argentino en la Copa Libertadores pero termina ganando el "pincha" por 3 a 2. Además ese año consigue su primer título internacional, la Copa Ciudad de Santa Marta en Colombia.
En 1976 continuan los buenos torneos ya que es subcampeón nuevamente del Metropolitano. Luego el protagonismo se iría diluyendo, volvería a ser el equipo de mitad de tabla y comenzarían los problemas institucionales que lo fueron debilitando. Solamente se destacan dos giras por el exterior donde consigue la Copa Ciudad Santiago de Chile en 1980 y la XVIII Trofeo Ibérico Ciudad de Badajoz.
Todo el mal momento se vio reflejado en la Temporada 1985/1986 donde perdió por primera vez en su historia la categoría luego de disputar un octogonal con equipos de Primera B y caer en la final ante Deportivo Italiano. Su primera experiencia en el ascenso no iba a ser de paso. Comienza a participar en el Nacional B que debutó como nueva categoría en la 1986/1987 y en esa oportunidad clasifica al reducido por el segundo ascenso pero queda eliminado en semifinales por Belgrano de Córdoba.
En el campeonato siguiente avanza nuevamente a la misma instancia pero queda afuera de la lucha del ascenso por Chaco for Ever. En la Temporada 1988/1989 otra vez clasifica al reducido pero esta vez avanza hasta la segunda ronda donde queda eliminado por Colón de Santa Fe. Finalmente llegó la 1989/1990 donde se consagra campeón tras una gran campaña culminando a siete puntos de Quilmes.
Nuevamente en la máxima categoría no tuvo actuaciones sobresalientes. La más importante fue en el Clausura 1993 donde llegó hasta la última jornada con posibilidades de salir campeón pero cayó categóricamente frente a Independiente, equipo que terminó llevándose el título.
Las últimas posiciones se repitieron en los torneos posteriores y todo se desencadenó en el segundo descenso en su historia, en la Temporada 1998/1999, cuando fue el peor promedio de la categoría. En esta oportunidad estuvo un solo año en la B Nacional ya que logra ganar la Zona Metropolitana, clasifica a instancias finales y obtiene el campeonato venciendo en la final a Quilmes.
Nuevamente en el fútbol grande, en las primeras dos temporadas se mantiene pero en la 2002/2003 sale último en el Apertura y Clausura y consigue uno de los dos peores promedios de la categoría que lo llevó a descender por tercera vez a la B Nacional.
En el 2004 obtuvo el subcampeonato del Torneo Apertura 2004 y la tercera posición en la tabla general de la temporada. Esto le dio dos posibilidades de ascenso a Primera División que no pudo aprovechar ya que la final por el segundo ascenso la perdió con Gimnasia (Jujuy) y en la promoción no pudo vencer a Instituto (Córdoba).
En la edición 2006/07, y de la mano del Turco Antonio Mohamed, realizó una gran temporada terminando en el tercer lugar de la tabla general, con lo cual clasificó para disputar dos finales ante San Martín de San Juan en busca de un nuevo ascenso. En el partido de ida en Parque de los Patricios se impuso por la mínima diferencia con tanto de Milano, mientras que en la revancha sobre la hora se quedó con las manos vacias tras perder por 3-1.
De igual manera el conjunto de Parque Patricios clasificó para disputar la Promoción ante Godoy Cruz. Ganó por 2-0 en Patricios (Coyette y Larrivey), y también vencio por 3-2 en Mendoza (Sánchez Prette, Milano y Gordillo) posibilitando esto regresar a Primera División.